بناي مسجد در نيمة اول قرن سيزدهم و در زمان ”فتحليشاه قاجار“ ساخته شده و بعدها در زمان ”ناصرالدين شاه قاجار“ تعميرات و تغييراتي در آن صورت گرفته است. بر بالاي در شمالي مسجد، قصيده اي از ساخت بنا سخن مي گويد و داراي مادة تاريخ زير است:
كلك مجمر از پي تاريخ سالش زد رقم پيش اين مسجد سزد گر قبله آيد در نماز
كه به حساب حروف ابجد سال 1225 را نشان مي دهد. در سال 1264 دورنمائي از محل فعلي مسجد امام توسط ”ژول لورانس“ نقاش فرانسوي ترسيم شده است. در اين نقاشي دومنارة طرفين ايوان شمالي مسجد ديده نمي شود و در عوض گلدستهاي بالاي همين ايوان وجود دارد. در كتاب ”مرآت البلدان“ آمده كه ناصرالدين شاه در سال 1296 دو مناره براي اين مسجد ساخته است و مؤلف كتاب آثار تاريخي طهران معتقد است، طي تعميراتي در سال 1307 كه در كتيبه سردر به آن اشاره شده، دو مناره نيز به بنا اضافه گشته است. بين سالهاي 1322 و 1323 ساعت موجود بين دو مناره نصب شده و در حدود 50 سال پيش شاخص قبله در جوار حوض مسجد تعبيه گشته است. در دهه هاي اخير ديوارها و سقف ايوانها را رنگ كرده و روي آنها نقاشي شده است. احداث دو وضوخانه در ورودي شمالي و تعويض و تجديد بناي حوض نيز از اقدامات اين سالهاست...